Sprawdź ścieżki do plików systemowych (baz i logów) we właściwościach baz oraz ich nazwy w tych bazach, które się konwertują bez problemu i w tych które robią problem. Może tak być (zwłaszcza jeśli serwer MS SQL był lub jest na Linuksie) że np. ukośniki w ścieżkach są w odwrotną stronę lub nawet /\ w nazwach i serwer MS SQL sobie z tym radzi, ale InsERT nie bardzo (ale działa na tym, problem wychodzi przy konwersji). Sprawdź też nazwy plików systemowych (czy mają rozszerzenia ldf i mdf w tych kłopotliwych bazach) i czy nazwy logiczne baz są ok i nie pokrywają się z jakimiś innymi bazami. I konwersję robisz na sa czy jakimś innym koncie? Może być różnica uprawnień konta, na którym robisz konwersje względem katalogów na dysku, gdzie lądują backupy lub do temp lub między bazami konwertującymi się ok i stwarzającymi problemy.