czy w subiekcie gt można ustawić różne sposoby numeracji dokumentów w zależności od magazynów.

tzn. czy np. w magazynie głównym będzie 01/10/mag/2018 a w magazynie drugim będzie tylko 01/10/2018. ?

powód jest jak zwykle nietypowy,

w drugim magazynie będziemy wprowadzać faktury wystawione przez podwykonawcę chodzi dokładnie o najem powierzchni handlowych gdzie właściciel wystawia faktury w magazynie głównym w numeracji np. 01/mag/2018, a zarządca nieruchomości wystawia dla najemców w imieniu właściciela re faktury za energię elektryczną o numeracji 01/10/2018 i jak się domyślasz w swoim kulawym programie nie może zrobić numeracji np. 10/10/ROZ/2018 .
Chcemy jednak te faktury ( które ujmujemy oczywiście w przychodach) wprowadzać do subiekta ze względu na jpk_faktura, stąd cały ambaras.

No to nie z tej strony się za to zabierasz, można wprowadzić numer dokumentu w inne pole (podtytuł, uwagi) i zmienić definicję pól JPK, aby pobierały numer dokumentu z tych pól.

no właśnie chciałem uniknąć jakiegoś dodatkowego wpisywania