Jak rozwiązać problem kiedy wystawiamy klientowi fakturę, a on odbiera towar cząstkowo i do każdego odbioru musimy wystawić oddzielną WZ?

Zmieć obieg dokumentów i wystawić fakturę końcową po wydaniu towaru. Ciężko zaproponować coś innego kiedy nie został opisany problem.

Czy jak mamy wystawioną fakturę zaliczkową też będzie to możliwe?

Są dwa typy faktur zaliczkowych - cząstkowe i końcowe - w międzyczasie można wielokrotnie wydawać towar... Jak najbardziej to dobre rozwiązanie do dokumentowania prac instalacyjnych/budowlanych.