W Subiekcie faktura zakupu i sprzedaży może mieć przypisaną tylko jedną transakcję VAT. Więc masz dwa wyjścia, albo kupować osobno na dwie faktury, wtedy jedna WNT a druga WTTN, albo mając jedną fakturę podzielić ją na osobne dwie faktury zakupu z odpowiednimi transakcjami VAT.
Ponieważ ta transakcja jest bez VAT, więc nie powinno być żadnego problemu z podzieleniem jej na dwie rózne.

Tak właśnie zaczęłam robic, tylko mam jeszcze taki problem, że czasami sprzedane mam kilka  dziesiąt kilo więcej niż miałam na zakupie.

To ta trzecia część będzie tylko WDT.